MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae 10810

Total Repeats: 41649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016809	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	378696080
2	NC_016809	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696080
3	NC_016809	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696080
4	NC_016809	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696080
5	NC_016809	A	6	6	344	349	100 %	0 %	0 %	0 %	378696080
6	NC_016809	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	378696080
7	NC_016809	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378696080
8	NC_016809	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696080
9	NC_016809	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696080
10	NC_016809	CAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696080
11	NC_016809	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	378696080
12	NC_016809	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378696080
13	NC_016809	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696080
14	NC_016809	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696080
15	NC_016809	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696080
16	NC_016809	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696080
17	NC_016809	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696080
18	NC_016809	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	378696080
19	NC_016809	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016809	T	6	6	1059	1064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016809	AAT	2	6	1125	1130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016809	TTC	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016809	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
24	NC_016809	GA	3	6	1310	1315	50 %	0 %	50 %	0 %	378696081
25	NC_016809	TCAA	2	8	1345	1352	50 %	25 %	0 %	25 %	378696081
26	NC_016809	TTGC	2	8	1365	1372	0 %	50 %	25 %	25 %	378696081
27	NC_016809	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696081
28	NC_016809	AGCA	2	8	1501	1508	50 %	0 %	25 %	25 %	378696081
29	NC_016809	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378696081
30	NC_016809	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696081
31	NC_016809	A	6	6	1609	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
32	NC_016809	CCA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378696081
33	NC_016809	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
34	NC_016809	TTA	2	6	1678	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696081
35	NC_016809	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
36	NC_016809	ATTT	2	8	1747	1754	25 %	75 %	0 %	0 %	378696081
37	NC_016809	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696081
38	NC_016809	TC	4	8	1817	1824	0 %	50 %	0 %	50 %	378696081
39	NC_016809	CTTT	2	8	1878	1885	0 %	75 %	0 %	25 %	378696081
40	NC_016809	T	6	6	1883	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	378696081
41	NC_016809	TC	3	6	1894	1899	0 %	50 %	0 %	50 %	378696081
42	NC_016809	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378696081
43	NC_016809	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696081
44	NC_016809	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
45	NC_016809	A	6	6	2038	2043	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
46	NC_016809	TGC	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378696081
47	NC_016809	A	6	6	2175	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
48	NC_016809	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696081
49	NC_016809	GGT	2	6	2232	2237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378696081
50	NC_016809	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696081
51	NC_016809	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378696081
52	NC_016809	AAC	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696081
53	NC_016809	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696081
54	NC_016809	GTG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378696081
55	NC_016809	TGA	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696081
56	NC_016809	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
57	NC_016809	ATTT	2	8	2569	2576	25 %	75 %	0 %	0 %	378696081
58	NC_016809	AT	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	378696081
59	NC_016809	CAC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378696081
60	NC_016809	AT	3	6	2636	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	378696081
61	NC_016809	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696081
62	NC_016809	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
63	NC_016809	GAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
64	NC_016809	ACT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696081
65	NC_016809	A	6	6	2798	2803	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
66	NC_016809	AGC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696081
67	NC_016809	A	7	7	2876	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	378696081
68	NC_016809	GCAA	2	8	2974	2981	50 %	0 %	25 %	25 %	378696081
69	NC_016809	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696081
70	NC_016809	CTTT	2	8	3038	3045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016809	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
72	NC_016809	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696082
73	NC_016809	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
74	NC_016809	TCA	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696082
75	NC_016809	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
76	NC_016809	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	378696082
77	NC_016809	CGCAC	2	10	3259	3268	20 %	0 %	20 %	60 %	378696082
78	NC_016809	A	6	6	3301	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	378696082
79	NC_016809	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	378696082
80	NC_016809	TCT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696082
81	NC_016809	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
82	NC_016809	TCA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696082
83	NC_016809	ATTT	2	8	3479	3486	25 %	75 %	0 %	0 %	378696082
84	NC_016809	ATT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
85	NC_016809	TAA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
86	NC_016809	GAT	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696082
87	NC_016809	GC	3	6	3632	3637	0 %	0 %	50 %	50 %	378696082
88	NC_016809	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696082
89	NC_016809	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696082
90	NC_016809	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696082
91	NC_016809	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696082
92	NC_016809	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696083
93	NC_016809	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696083
94	NC_016809	TTC	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696083
95	NC_016809	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696083
96	NC_016809	GAC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696083
97	NC_016809	ATTCT	2	10	4318	4327	20 %	60 %	0 %	20 %	378696083
98	NC_016809	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016809	CCA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016809	TC	3	6	4552	4557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016809	TTTCCT	2	12	4606	4617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696084
102	NC_016809	T	6	6	4724	4729	0 %	100 %	0 %	0 %	378696084
103	NC_016809	CTCG	2	8	4744	4751	0 %	25 %	25 %	50 %	378696084
104	NC_016809	TAAAA	2	10	4761	4770	80 %	20 %	0 %	0 %	378696084
105	NC_016809	CCAA	2	8	4797	4804	50 %	0 %	0 %	50 %	378696084
106	NC_016809	T	7	7	4921	4927	0 %	100 %	0 %	0 %	378696084
107	NC_016809	TA	3	6	5000	5005	50 %	50 %	0 %	0 %	378696084
108	NC_016809	ACG	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696084
109	NC_016809	ACA	2	6	5137	5142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696084
110	NC_016809	TCT	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696084
111	NC_016809	CAT	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696084
112	NC_016809	TA	3	6	5258	5263	50 %	50 %	0 %	0 %	378696084
113	NC_016809	TTG	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696084
114	NC_016809	T	6	6	5335	5340	0 %	100 %	0 %	0 %	378696084
115	NC_016809	A	6	6	5349	5354	100 %	0 %	0 %	0 %	378696084
116	NC_016809	TTA	2	6	5385	5390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016809	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016809	TTG	2	6	5459	5464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016809	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016809	GAT	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016809	TA	3	6	5548	5553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016809	AG	3	6	5556	5561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016809	CTA	2	6	5592	5597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016809	CTAT	2	8	5612	5619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016809	CAA	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016809	TTG	3	9	5634	5642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016809	AAG	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016809	TTC	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016809	AGG	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016809	ATT	2	6	5771	5776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016809	CG	3	6	5778	5783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016809	TGT	2	6	5830	5835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016809	TA	3	6	5836	5841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016809	AGC	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016809	ATC	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016809	CAGT	2	8	5932	5939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016809	GTG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016809	TTG	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016809	TTA	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016809	CAT	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016809	ATC	2	6	6354	6359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016809	GAA	2	6	6419	6424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016809	ATC	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016809	GTTCTG	2	12	6502	6513	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_016809	AAAC	2	8	6553	6560	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016809	CAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016809	TGA	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016809	GAA	2	6	6657	6662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016809	TGA	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016809	ACA	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_016809	CTT	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016809	GAA	2	6	6849	6854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016809	TAT	2	6	7164	7169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016809	ATG	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016809	TGA	2	6	7303	7308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016809	AAATAA	2	12	7367	7378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016809	ATC	2	6	7439	7444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_016809	ATG	2	6	7474	7479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016809	ACT	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_016809	GAA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016809	A	6	6	7668	7673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016809	TGA	2	6	7856	7861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016809	ACA	3	9	7866	7874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_016809	CCG	2	6	7997	8002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_016809	CAT	2	6	8020	8025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_016809	AACTGG	2	12	8085	8096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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170	NC_016809	GTA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016809	CAA	2	6	8350	8355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_016809	ATC	2	6	8409	8414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_016809	CACAAC	2	12	8416	8427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_016809	TCG	2	6	8501	8506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_016809	TTA	2	6	12301	12306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016809	T	6	6	12402	12407	0 %	100 %	0 %	0 %	378696090
260	NC_016809	TAT	2	6	12421	12426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696090
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269	NC_016809	ATA	2	6	12919	12924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696090
270	NC_016809	A	7	7	12983	12989	100 %	0 %	0 %	0 %	378696090
271	NC_016809	AGA	2	6	13115	13120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378696090
272	NC_016809	ATTTG	2	10	13124	13133	20 %	60 %	20 %	0 %	378696090
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402	NC_016809	CA	3	6	18946	18951	50 %	0 %	0 %	50 %	378696096
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